中国中药杂志

2019, v.44(12) 2480-2485

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丹参酮生物合成途径CYP450基因相关长链非编码RNA的筛选
Screening of long non-coding RNA related to CYP450s involved in biosynthesis of tanshinones

蔡媛;马莹;郭娟;王勇庆;杜青;陈同;张水寒;黄璐琦;

摘要(Abstract):

丹参酮是中药丹参的主要有效成分,其生物合成途径表明细胞色素CYP450酶在丹参酮生物合成途径结构后修饰过程中发挥着重要作用。长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200 nt的核苷酸,对药用植物的生长发育、次生代谢等具有重要调控作用。该研究通过对丹参毛状根进行诱导,利用高通量测序构建其长链非编码RNA文库,共获得8 942个差异lncRNA,其中6 755个基因间lncRNA,并鉴定出1 115 814个lncRNA-靶基因对,包括122个lncRNA-靶基因顺式对。对差异lncRNA与CYP450进行相关性分析,共鉴定出16 249个lncRNA-CYP450靶基因对。将其与丹参酮生物合成途径CYP76AH1,CYP76AH3,CYP76AK1基因进行靶向相关性分析,得到216个靶基因,这些候选基因为丹参酮生物合成途径下游调控机制研究奠定基础。

关键词(KeyWords): 丹参;丹参酮;长链非编码RNA;CYP450

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金青年基金项目(81503197,81573532.81822046);; 中央本级重大增减支项目(2060302);; 湖南省自然科学基金青年基金项目(2018JJ3310);; 湖南省中医药管理局项目(201810);; 湖湘中药资源保护与利用2011协同创新中心项目

作者(Author): 蔡媛;马莹;郭娟;王勇庆;杜青;陈同;张水寒;黄璐琦;

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