中国中药杂志

2008, (13) 1523-1527

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石蒜属叶绿体trnL-F序列的变异与系统聚类分析
Genetic variations in trnL-F sequence and phylogenetic clustering of Lycoris species

袁菊红;孙视;彭峰;冯煦;郑玉红;夏冰;

摘要(Abstract):

目的:分析比较石蒜属和近缘属植物中国水仙trnL基因的部分序列和trnL-trnF间隔区的完整序列,为石蒜属物种鉴别和种间亲缘关系分析提供分子佐证。方法:采用PCR产物直接双向测序法,用Clustal X 1.81,MEGA 2.0软件进行序列分析,采用最大简约法(maximum parsimony,MP)构建系统发育树。结果:所测物种的序列全长在905~1036 bp,经排序后,两端切平,得到886 bp的整齐序列,所测物种的核苷酸变异位点14个,信息位点10个,主要在trnL内含子区,这些位点可用于区分石蒜属物种;4个碱基"ATAT"缺失/插入是区别石蒜属与其近缘植物水仙的显著特征。重建的系统发育树表明:供试的石蒜属物种聚成3类,除稻草石蒜、忽地笑、香石蒜的系统位置有所不同之外,与经典分类结果基本相符。水仙属2个种形成1个单系类群,表明属间trnL-F序列差异明显。结论:分子系统树支持安徽石蒜是长筒石蒜的变种或杂交种观点,换锦花可能是玫瑰石蒜、红蓝石蒜的杂交母本。石蒜属种间trnL-F序列存在一定变异,是物种鉴别的有效分子标记。

关键词(KeyWords): 石蒜属;tmL-F序列;序列变异;分子鉴别;系统树

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金项目(30370292);; 江苏省科技基础设施建设计划项目(BM2006104)

作者(Author): 袁菊红;孙视;彭峰;冯煦;郑玉红;夏冰;

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