中国中药杂志

2019, v.44(16) 3594-3600

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雷公藤CYP450生物信息学及组织分布分析
Bioinformatics and tissue distribution analysis of Tripterygium wilfordii CYP450

高杰;张逸风;周家伟;吴晓毅;高伟;黄璐琦;

摘要(Abstract):

细胞色素P450家族是一种广泛存在于自然界中的生物催化剂,它具有催化植物次生代谢产物生物合成、调节植物修复等多种功能。该研究基于对雷公藤蛋白组数据的分析,利用多种生物信息学分析的方法对雷公藤CYP450基因进行了初步分析和预测,文章结果显示,使用茉莉酸甲酯诱导雷公藤悬浮细胞表达后,获取到雷公藤蛋白组数据并对其进行分析,最终筛选出10条雷公藤CYP450蛋白;通过分析与拟南芥家族CYP450基因构建得到的系统进化树,将这10条CYP450蛋白聚类归为6个不同的CYP450家族,各个家族CYP450蛋白质的理化性质存在一定差异,二级结构主要以不规则卷曲为主要构成元件,其中8条CYP450蛋白亚细胞定位结果为叶绿体,其余为质体;随后,通过对多重序列比对结果进行分析,找到了CYP450基因共有的保守结构域(亚铁血红素活性位点);最后,通过分析雷公藤转录组数据,初步确认了其在不同组织中的表达分布,从而验证了其与雷公藤活性物质生物合成具有相关性,为雷公藤有效活性成分生物合成途径解析提供了重要的基因资源。

关键词(KeyWords): 雷公藤;CYP450;生物信息学

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金项目(81773830);; 北京市自然科学基金项目;; 北京市教育委员会科技发展计划重点项目(KZ201710025022);; 北京市属高校长城学者培养计划项目(CIT&TCD20170324toW.G.);; “万人计划”青年拔尖人才项目

作者(Author): 高杰;张逸风;周家伟;吴晓毅;高伟;黄璐琦;

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